U grupnoj fazi će igrati ukupno 32 ekipe podeljene u 4 grupe a pored Mega Leksa, u FIBA Ligi šampiona će igrati još: ASVEL, Strazbur, Monako, Le Man (Francuska), Banvit, Karšijaka (Turska), Aris, PAOK (Grčka), Avelino, Venecija (Italija), Skajlajners, Iv Baskets Oldenburg (Nemačka), Ostende (Belgija), Makabi Rišon (Izrael), Cibona (Hrvatska), Nimburk (Češka), Neptunas (Litvanija), Rosa Radom (Poljska), Helios (Slovenija), Tenerife (Španija), Saratov (Rusija), Himik (Ukrajina) i Ventspils (Letonija).
U prvom kolu kvalifikacija učestvovaće litvanski Juventus, Kataja iz Finske, Igokea, Rilski iz Bugarske, Tsmok (Belorusija), Groningen (Holandija), Mornar Bar, Tartu (Estonija), Oradea i Kluž (Rumunija), Prievidza (Slovačka), Baken (Danska), Sedertalje (Švedska), Porto i Benfika (Portugalija) i AEK (Kipar).
U drugom kolu kvalifikacija učestvovaće Lukoil (Bugarska), Solnok (Mađarska), Šarlroa (Belgija), Bešiktaš (Turska), Ironi Naharija (Izrael), Usak (Turska), Vareze (Italija) i Ludvigzburg (Nemačka).
Žreb za prvu sezonu FIBA Lige šampiona biće održan 21. jula u Minhenu. Kvalifikacije počinje 27. septembra, a grupna faza 20. oktobra.