Stojković je trenutno član Notingem Foresta, a poslednjih nekoliko danas pominjalo se u srpskim medijima da bi mogao da nastavi karijeru u Partizanu.
Stojković je u karijeri branio za Crvenu zvezdu, Leotar, Zemun, Nant, Vitese, Sporting, Hetafe, Vigan, Partizan, Ergotelis i Makabi iz Haife.
