Njegova supruga, advokatica Amal, i on čekaju blizance, koji na svet dolaze u junu. Par se venčao u septembru 2014. na tajnoj ceremoniji u Veneciji. Luksuzna svadba održala se u hotelu „Aman“, a tada su se okupili najbliži Klunijevi prijatelji, između ostalih i Sindi Kraford, njen suprug Rendi Gerber, glumci Bil Mari i Met Dejmon, pevač Bono Voks. Najdugovečniji neženja je zapravo pre nego što je postao megapopularan imao jedan brak iza sebe. On se 1989. godine oženio glumicom Talijom Balsam, a pet godina kasnije se razveo i izjavio da se više nikada neće ženiti.
Ipak, Kluni je pre nego što je pogazio svoju reč o ženidbi bio sa brojnim lepoticama Holivuda, a opšte je poznato da je sklon dugim vezama. J. Stuparušić
